Zespół Szkół Specjalnych nr 6 prowadzi rekrutację przez cały rok na wszystkie etapy edukacji i do każdej klasy, a ponadto nie podlega rejonizacji.
Rodzice/Opiekunowie prawni mają prawo ubiegać się o bezpłatny dowóz dziecka do szkoły.
Formalnościami związanymi z przesłaniem dokumentacji do UMK zajmują się Rodzice.
Przy rekrutacji do szkół specjalnych nie obowiązuje Decyzja Małopolskiego Kuratora Oświaty w sprawie terminów rekrutacji do szkół.
Szkoła nie prowadzi rekrutacji elektronicznej.